Trong qúa trình tiến hóa nhỏ, sự cách li có vai trò:

Làm thay đổi tần số alen từ đó hình thành loài mới.

Tăng cường sự khác nhau về kiểu gen giữa các loài, các họ.

Xóa nhòa những khác biệt về vốn gen giữa hai quần thể đã phân li.